OurSci Magazine, 2002.02.01 Vol 2, No. 8

三思科学杂志
《三思科学》电子杂志 2002年第2期 总第8期 2002年2月1日
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求知

   干 扰
  ——RNAi漫谈

   作者 落雪

线虫
  1995年,康乃尔大学的Su Guo博士在试图阻断秀丽新小杆线 虫(C. elegans)中的par-1基因时,发现了一个意想不到的现 象。她们本是利用反义RNA技术特异性地阻断上述基因的表达, 而同时在对照实验中给线虫注射正义RNA(sense RNA)以期观察 到基因表达的增强。但得到的结果是二者都同样地切断了par-1 基因的表达途径。这是与传统上对反义RNA技术的解释正好相反 的。该研究小组一直没能给这个意外以合理解释。   直到1998年2月,华盛顿卡耐基研究院的Andrew Fire和马萨 诸塞大学医学院的Craig Mello才首次揭开这个悬疑之谜。通过 大量艰苦的工作,他们证实,Su Guo博士遇到的正义RNA抑制基 因表达的现象,以及过去的反义RNA技术对基因表达的阻断,都 是由于体外转录所得RNA中污染了微量双链RNA而引起。当他们将 体外转录得到的单链RNA纯化后注射线虫时发现,基因抑制效应 变得十分微弱,而经过纯化的双链RNA却正好相反,能够高效特 异性阻断相应基因的表达。该小组将这一现象称为RNA干扰(RNA interference ,简称RNAi)。   在随后的短短一年中,RNAi现象被广泛地发现于真菌、拟南 芥、水螅、涡虫、锥虫、斑马鱼等大多数真核生物中。这种存在 揭示了RNAi很可能是出现于生命进化的早期阶段。随着研究的不 断深入,RNAi的机制正在被逐步阐明,而同时作为功能基因组研 究领域中的有力工具,RNAi也越来越为人们所重视。 RNAi的作用机制
RNAi作用机制

RNAi作用机制图解
(以线虫中的三种不同形式为例)
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  体外实验表明:RNAi反应中,
加入的dsRNA被切割为21-23核苷
酸长的RNA片段,后者会使目的
mRNA被切割为21-23核苷酸长的
片段。从已经发生RNAi的果蝇S2
细胞中,Hammond等人部分纯化
了一种核酸酶,该核酸酶具有序
列特异性,它仅降解与引起RNAi
的dsRNA具有同源序列的mRNA。
那么这种核酸酶是如何确定哪些
mRNA该降解而哪些不该呢?由
于在纯化该核酸酶时,可以共分
离出21-23核苷酸长的 dsRNA 片
段,这暗示该核酸酶对mRNA的
切割有可能是以这些片段作模板
指导进行的。根据以上的实验结
果,人们提出一种RNAi作用的简
单模型。当dsRNA导入细胞后,
被一种dsRNA特异的核酸内切酶
识别,切割成21-23核苷酸长的小
片段,这些片段可与该核酸酶的
dsRNA结合结构域结合,并且作
为模板识别目的mRNA;识别之
后,mRNA与dsRNA的有义链发
生链互换,原先dsRNA中的有义
链被mRNA代替,从酶-dsRNA复
合物中释放出来,而mRNA则处
于原先的有义链的位置。核酸酶
在同样位置对mRNA进行切割,
这样又产生了21-23核苷酸长的
dsRNA小片段,与核酸酶形成复
合物,继续对目的mRNA进行切
割,从而使目的基因沉默,产生
RNAi现象。通过遗传分析的方法,
目前已从线虫中已分离到RDE-2,
RDE-3和Mut-7等RNAi相关的基因。
RNAi技术在功能基因组中的应用   在功能基因组研究中,需要对特定基因进行功能丧失或降低 突变,以确定其功能。由于RNAi具有高度的序列专一性,可以特 异地使特定基因沉默,获得功能丧失或降低突变,因此RNAi可以 作为一种强有力的研究工具,用于功能基因组的研究。将功能未 知的基因的编码区(外显子)或启动子区,以反向重复的方式由 同一启动子控制表达。这样在转基因个体内转录出的RNA可形成 dsRNA,产生RNA干涉,使目的基因沉默,从而进一步研究目的基 因的功能,这种技术即为RNAi技术。根据所选用序列的不同,可 将其分为编码区RNAi和启动子区RNAi技术。   1.编码区RNAi技术   自1998年在线虫中发现RNAi现象以来,以基因编码区为靶序 列的编码区RNAi技术已用于线虫功能基因组的研究。最初这种技 术是通过注射或浸泡等方法直接导入到线虫的性腺或早期胚胎中。 这些方法虽然可以关闭目的基因的表达,产生突变表型,但这种 表型变化却不能遗传。这种早期的RNAi技术可以用于研究与胚胎 发育有关的基因的功能,但由于细胞分裂造成dsRNA的稀释,使 得这种方法在研究成体的基因功能时有一定的局限性。为弥补早 期RNAi技术的上述不足,Tavernarakis等对RNAi技术进行了改进, 将目的基因的靶序列以反向重复的方式,由热激启动子控制在转 基因生物中表达。热激处理后,反向重复序列在细胞内开始转录, 其产物会形成具发夹环结构的dsRNA,从而产生RNAi,使目的基 因沉默。这种改进的RNAi技术与传统的RNAi技术相比,具有明显 的优点:首先转基因可以遗传给后代,有利于突变的分析;其次 dsRNA可以被诱导产生,RNAi能够在发育特定阶段出现,从而使 研究发育早期必需基因在发育晚期的功能成为可能;另外,当用 细胞特异性启动子控制dsRNA的表达时,可以研究特定基因在不 同器官中的功能。Kennerdell J. R.和CarthewR. W.用GAL4/UAS 系统控制dsRNA在果蝇中的表达,实现了诱导性或细胞特异性控 制RNAi的发生。   随着应用RNAi技术研究线虫功能基因组工作的开展,研究人 员对该技术在植物中应用的可能性进行了探索。加州理工大学的 Chuang C. F.和Megerowitz E. M.使用此技术研究了拟南芥的AG, CLV3, AP1, PAN四个开花相关基因。结果表明使用RNAi技术可以 产生功能丧失或降低突变体,其表型与以前通过其它方法鉴定的 突变体类似。RNA原位杂交表明,RNAi突变体的目的mRNA显著降 低。该结果说明RNAi技术亦可以成为植物功能基因组研究中的有 力工具。   2.启动子区RNAi技术   M. F. Mett等证明含有启动子区的dsRNA在植物体内同样被 切割成21-23核苷酸长的片段,这种dsRNA可使内源相应的DNA序 列甲基化,从而使启动子失去功能,使其下游基因沉默。   由于多基因家族的各成员之间高度同源,因而使用编码区 RNAi技术很难将各个成员区分开来研究,而多基因家族内的启动 子序列通常比编码区变化大, 采用启动子区RNAi技术有望将多 基因家族的各个成员区分开来研究。这样综合编码区RNAi技术和 启动子区RNAi技术的信息即可更全面地了解多基因家族地各成员 的功能。   RNAi现象存在的广泛性远远超过人们的预期,对此问题的深 入研究结果将为进化的观点提供有力佐证。而与其它几种进行功 能丧失或降低突变的技术相比,RNAi技术具有明显的优点,它比 反义RNA技术和同源共抑制更有效,更容易产生功能丧失或降低 突变。而且通过
     fly
  一种特殊的细胞切除术、反义表达以及RNAi对果蝇胚胎的肌肉   建成与基因表达的影响。点击图片可放大。   与细胞特异性启动子及可诱导系统结合使用,可以在发育的 不同时期或不同器官中有选择地进行,与T-DNA技术造成的功能 永久性缺失相比,这是更受科学家偏爱的。我坚信,由于科学家 们的努力工作,一个崭新的RNA时代呼之欲出。

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