 《三思科学》电子杂志
2002年第2期 总第8期
2002年2月1日
目 录
封面
封面故事
[九歌]鸟类漫话——猛禽
编者的话
[柯南]蓝猫还是“烂猫”?
新闻
[李淼]地球引力场中中子的量子态
[春上莱茵早]最近的梦为何总那么远
[春上莱茵早]赚钱?拿出你的诚意来
[碧声]小猪,比以前更乖
[碧声]绕开伦理障碍
[柯南]死刑:再次推迟
求知
[石青]接触地外文明
[沈建其]百年量子
[武强]超光速存在吗?
[刘华杰]虹霓有别
[李淼]弦论通俗演义(三)
弦论通俗演义(四)
弦论通俗演义(五)
[异调]联合起来,变得虚弱(下)
[韩雪涛]三环亲和数链是否存在
[小江]癌症是什么
[Aha]软物质:熵统治的世界
[小茜]吃饭这事儿
[落雪]干扰————RNAi漫谈
[九歌]植物能源的前景
译述
科学美国人:星际之流
自然:印度在线
新科学家:光速
故事
[佳肴]一只龙蜥和一碗佳肴的故事
观点
[柯南]魔鬼出没的书店
[向东]我们的教育怎么了
[马庆池]为中国科学普及事业不
景气而疾首
历史
[异调]ENIGMA的兴亡(续完)
书评
[一笑]《惊人的假说——灵魂的
科学探索》读书笔记(三)
辨伪
[方舟子]达尔文的眼睛
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干 扰
——RNAi漫谈
落雪
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1995年,康乃尔大学的Su Guo博士在试图阻断秀丽新小杆线
虫(C. elegans)中的par-1基因时,发现了一个意想不到的现
象。她们本是利用反义RNA技术特异性地阻断上述基因的表达,
而同时在对照实验中给线虫注射正义RNA(sense RNA)以期观察
到基因表达的增强。但得到的结果是二者都同样地切断了par-1
基因的表达途径。这是与传统上对反义RNA技术的解释正好相反
的。该研究小组一直没能给这个意外以合理解释。
直到1998年2月,华盛顿卡耐基研究院的Andrew Fire和马萨
诸塞大学医学院的Craig Mello才首次揭开这个悬疑之谜。通过
大量艰苦的工作,他们证实,Su Guo博士遇到的正义RNA抑制基
因表达的现象,以及过去的反义RNA技术对基因表达的阻断,都
是由于体外转录所得RNA中污染了微量双链RNA而引起。当他们将
体外转录得到的单链RNA纯化后注射线虫时发现,基因抑制效应
变得十分微弱,而经过纯化的双链RNA却正好相反,能够高效特
异性阻断相应基因的表达。该小组将这一现象称为RNA干扰(RNA
interference ,简称RNAi)。
在随后的短短一年中,RNAi现象被广泛地发现于真菌、拟南
芥、水螅、涡虫、锥虫、斑马鱼等大多数真核生物中。这种存在
揭示了RNAi很可能是出现于生命进化的早期阶段。随着研究的不
断深入,RNAi的机制正在被逐步阐明,而同时作为功能基因组研
究领域中的有力工具,RNAi也越来越为人们所重视。
RNAi的作用机制

RNAi作用机制图解
(以线虫中的三种不同形式为例)
点击图片可放大
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体外实验表明:RNAi反应中,
加入的dsRNA被切割为21-23核苷
酸长的RNA片段,后者会使目的
mRNA被切割为21-23核苷酸长的
片段。从已经发生RNAi的果蝇S2
细胞中,Hammond等人部分纯化
了一种核酸酶,该核酸酶具有序
列特异性,它仅降解与引起RNAi
的dsRNA具有同源序列的mRNA。
那么这种核酸酶是如何确定哪些
mRNA该降解而哪些不该呢?由
于在纯化该核酸酶时,可以共分
离出21-23核苷酸长的 dsRNA 片
段,这暗示该核酸酶对mRNA的
切割有可能是以这些片段作模板
指导进行的。根据以上的实验结
果,人们提出一种RNAi作用的简
单模型。当dsRNA导入细胞后,
被一种dsRNA特异的核酸内切酶
识别,切割成21-23核苷酸长的小
片段,这些片段可与该核酸酶的
dsRNA结合结构域结合,并且作
为模板识别目的mRNA;识别之
后,mRNA与dsRNA的有义链发
生链互换,原先dsRNA中的有义
链被mRNA代替,从酶-dsRNA复
合物中释放出来,而mRNA则处
于原先的有义链的位置。核酸酶
在同样位置对mRNA进行切割,
这样又产生了21-23核苷酸长的
dsRNA小片段,与核酸酶形成复
合物,继续对目的mRNA进行切
割,从而使目的基因沉默,产生
RNAi现象。通过遗传分析的方法,
目前已从线虫中已分离到RDE-2,
RDE-3和Mut-7等RNAi相关的基因。
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RNAi技术在功能基因组中的应用
在功能基因组研究中,需要对特定基因进行功能丧失或降低
突变,以确定其功能。由于RNAi具有高度的序列专一性,可以特
异地使特定基因沉默,获得功能丧失或降低突变,因此RNAi可以
作为一种强有力的研究工具,用于功能基因组的研究。将功能未
知的基因的编码区(外显子)或启动子区,以反向重复的方式由
同一启动子控制表达。这样在转基因个体内转录出的RNA可形成
dsRNA,产生RNA干涉,使目的基因沉默,从而进一步研究目的基
因的功能,这种技术即为RNAi技术。根据所选用序列的不同,可
将其分为编码区RNAi和启动子区RNAi技术。
1.编码区RNAi技术
自1998年在线虫中发现RNAi现象以来,以基因编码区为靶序
列的编码区RNAi技术已用于线虫功能基因组的研究。最初这种技
术是通过注射或浸泡等方法直接导入到线虫的性腺或早期胚胎中。
这些方法虽然可以关闭目的基因的表达,产生突变表型,但这种
表型变化却不能遗传。这种早期的RNAi技术可以用于研究与胚胎
发育有关的基因的功能,但由于细胞分裂造成dsRNA的稀释,使
得这种方法在研究成体的基因功能时有一定的局限性。为弥补早
期RNAi技术的上述不足,Tavernarakis等对RNAi技术进行了改进,
将目的基因的靶序列以反向重复的方式,由热激启动子控制在转
基因生物中表达。热激处理后,反向重复序列在细胞内开始转录,
其产物会形成具发夹环结构的dsRNA,从而产生RNAi,使目的基
因沉默。这种改进的RNAi技术与传统的RNAi技术相比,具有明显
的优点:首先转基因可以遗传给后代,有利于突变的分析;其次
dsRNA可以被诱导产生,RNAi能够在发育特定阶段出现,从而使
研究发育早期必需基因在发育晚期的功能成为可能;另外,当用
细胞特异性启动子控制dsRNA的表达时,可以研究特定基因在不
同器官中的功能。Kennerdell J. R.和CarthewR. W.用GAL4/UAS
系统控制dsRNA在果蝇中的表达,实现了诱导性或细胞特异性控
制RNAi的发生。
随着应用RNAi技术研究线虫功能基因组工作的开展,研究人
员对该技术在植物中应用的可能性进行了探索。加州理工大学的
Chuang C. F.和Megerowitz E. M.使用此技术研究了拟南芥的AG,
CLV3, AP1, PAN四个开花相关基因。结果表明使用RNAi技术可以
产生功能丧失或降低突变体,其表型与以前通过其它方法鉴定的
突变体类似。RNA原位杂交表明,RNAi突变体的目的mRNA显著降
低。该结果说明RNAi技术亦可以成为植物功能基因组研究中的有
力工具。
2.启动子区RNAi技术
M. F. Mett等证明含有启动子区的dsRNA在植物体内同样被
切割成21-23核苷酸长的片段,这种dsRNA可使内源相应的DNA序
列甲基化,从而使启动子失去功能,使其下游基因沉默。
由于多基因家族的各成员之间高度同源,因而使用编码区
RNAi技术很难将各个成员区分开来研究,而多基因家族内的启动
子序列通常比编码区变化大, 采用启动子区RNAi技术有望将多
基因家族的各个成员区分开来研究。这样综合编码区RNAi技术和
启动子区RNAi技术的信息即可更全面地了解多基因家族地各成员
的功能。
RNAi现象存在的广泛性远远超过人们的预期,对此问题的深
入研究结果将为进化的观点提供有力佐证。而与其它几种进行功
能丧失或降低突变的技术相比,RNAi技术具有明显的优点,它比
反义RNA技术和同源共抑制更有效,更容易产生功能丧失或降低
突变。而且通过
一种特殊的细胞切除术、反义表达以及RNAi对果蝇胚胎的肌肉
建成与基因表达的影响。点击图片可放大。
与细胞特异性启动子及可诱导系统结合使用,可以在发育的
不同时期或不同器官中有选择地进行,与T-DNA技术造成的功能
永久性缺失相比,这是更受科学家偏爱的。我坚信,由于科学家
们的努力工作,一个崭新的RNA时代呼之欲出。
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